如果饮水机长期没有清洗消毒，会污染水质并有可能危害到人体健康。因此，专家提醒，对饮水机进行定期的消毒、清洗是很有必要的。
饮水机在使用时，同等体积的空气会携带细菌、病毒等微生物进入饮水机内部并渗透到盛水桶，时间一长就会增加水的浑浊度和有机耗氧污染数，从而改变原本洁净的水。
饮水机、饮用水标准规定允许的菌类总数在70／ML。权威卫生部门测试，细菌在30℃左右的条件下，繁殖率每隔十几分钟就可翻一番，并呈几何级倍数增长。
所以，饮水机消毒剂的选择也有讲究，目前市场上的饮水机消毒剂有好几种，比较理想的是稳定性二氧化氯溶液饮水机消毒剂，它无刺激性对人体无害，与水无限互溶并迅速释放出杀菌有效成分，能在较短时间内杀灭病毒。此外，它与水中无机的或有机物不生成有毒物质，它的安全被世界卫生组织列为AI级，是一种较理想的广谱型消毒剂。
专家建议2－3个月左右清洗一次，频繁的清洗也不科学，一是没必要再是经常消毒会损坏到饮水机。由于有的饮水机是要拆盖后清洗而且得配备专门的饮水机消毒剂，最好是请专业厂家的专业饮水机维护人员进行维护。(2003年5月7日《厦门晚报》)
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