原因一是提DNA或RNA的样品被动物性材料污染。可能来自植物本身的沾带（叶片等外部没洗干净，沾有虫卵或分泌物）或内部（比如钻进茎或果实里的虫或虫卵），或者曾研磨过动物材料的研钵没洗干净，液氮罐曾经被污染过导致液氮带污染，水浴时进水等。或者是PCR过程中被气溶胶污染。还有可能克隆到的不是动物基因，而是植物中的同源基因（很多同类基因在真核生物中都有），但不是目的基因，这时说明扩增特异性不够，调整PCR程序，或换引物。
