不同的寄主被害后所表现的症状不完全相同。香蕉被侵染后,根表面产生红褐色略凹陷的病斑,病根可见皮层红褐色条斑,随着病害的发展;根组织变黑腐烂。香蕉地上部表现为生长缓慢,叶片小,枯黄,坐果少,果实小。由于根系被破坏,固着能力弱,蕉株易摇摆、倒伏或翻蔸,故香蕉穿孔线虫病又有“黑头倒塌病”(black head toping disease)之称。其他寄主植物被害,一般表现为根部出现大量空腔,韧皮部和形成层可完全毁坏,出现充满线虫的间隙,使中柱的其余部分与皮层分开,根部坏死斑橘黄色、紫色或褐色,坏死斑外部形成裂缝,根腐烂。地上部一般表现为叶片缩小,变色,新枝生长弱等衰退症状。