解: 设购买甲种小鸡苗只,那么乙种小鸡苗为(200-)只.
(1)根据题意列方程,得,
解这个方程得:(只),
(只),即:购买甲种小鸡苗1500只,乙种小鸡苗500只.
(2)根据题意得:,
解得:,·
即:选购甲种小鸡苗至少为1300只.
(3)设购买这批小鸡苗总费用为元,
根据题意得:,
又由题意得:,解得:,
因为购买这批小鸡苗的总费用随增大而减小,所以当=1200时,总费用最小,乙种小鸡为:2000-1200=800(只),即:购买甲种小鸡苗为1200只,乙种小鸡苗为800只时,总费用最小,最小为4800元.