1、不能！因为只用java来做一个网站很不现实。那需要你自己开发N多东西。简单说java一般作为WEB应用的后台控制，实现业务逻辑以及与数据库交互。页面可以用jsp或者其他视图。
2、java是一种统称。J2EE更有针对性，主要用于企业级的WEB开发。用jsp做肯定算是用java开发，因为java会先把jsp转换成servlet代码，再执行。
3、学习Java用什么软件？很让人费解啊～先买本《java核心技术》看吧，了解下基础。现在最流行的Java集成开发环境是Eclipse，有了一定的基础以后可以再找找这方面的教程
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