A、蝙蝠和鲸都具有胎生哺乳的特征,同属于哺乳纲,即同纲,因此它们的亲缘关系相对最近,可见A符合题意.故A正确; BC、始祖鸟和燕子属于鸟纲,而蝙蝠属于哺乳纲,因此蝙蝠与始祖鸟和燕子同属于脊索动物门.即同门.所以蝙蝠与始祖鸟和燕子的亲缘关系不如和鲸的亲缘关系近,故BC错误; D、蝴蝶属于无脊椎动物,因此蝴蝶和蝙蝠同属于动物界.即同界.因此二者的亲缘关系最远,故D错误. 故选:A