乙肝小三阳能否办理健康证，还需要依据个人的情况。如果乙肝小三阳肝功能正常，病情长期处于稳定状态，是可以办理除国家限制以外行业的健康证的，并且除国家禁止从事行业外，是可以同等享受公平竞争权力的。因此当乙肝小三阳患者在工作当中发现自己的权益受损，则可以运用法律武器保护自己。如果乙肝小三阳肝功能异常，HBV-DNA阳性，提示病情处于不稳定期且传染性强，这个时候就不能办理健康证。
