采用十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）可以确定天然蛋白质的分子量，采用体积排阻色谱法可以去顶各组成亚基的分子量。
可以采用各种电泳方法，其原理就是根据分子量的大小不同起电泳的速度也不同，然后再对比Marker来确定其分子量的大小，此方法不只试用于蛋白质，还可用于dna分子量大小的测定，种类很多，根据具体材料来定具体方法，有琼脂糖凝胶电泳，聚丙烯酰胺凝胶电泳等
