抗生素都是要用过滤除菌的
若是污染真菌，使用两性霉素B；细菌的话，使用青霉素、链霉素都行，浓度要自己把握好，因为抗生素对植物也是有抑制作用的。
但是靠抗生素来除去细菌或真菌污染并不是很彻底的方法，最关键的是对外植体进行表面消毒要彻底，这才是最根本的。
组培使用抗生素主要作用是减少植物繁殖体受微生物的污染，一般用在外植体建立初期；由于抗生素往往影响植物繁殖体的生长，产生变异，在微生物污染不超过10%的情况下，都不主张使用抗生素。在生根阶段培养基添加抗生素，会导致植物变异，但当抗生素作用消除或彻底解除后，变异个体多数都会恢复正常。
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