A.分子晶体熔化时一般破坏分子间作用力,而不影响化学键,如碘单质熔化,故A错误; B.原子晶体的原子间只存在共价键,某些分子晶体内只存在范德华力和氢键,如水、氨气等,故B错误; C.构成晶体的粒子在微观空间里呈现周期性的有序排列,晶体的这一结构特征可以通过X-射线衍射图谱反映出来.因此,区分晶体和非晶体的最可靠的科学方法是对固体进行X-射线衍射实验,故C正确; D.铵盐是非金属元素组成的化合物,属于离子化合物,氯化铝是金属元素与非金属元素组成的共价化合物,故D错误; 故选C.