公司由于我不能出差辞退我，并且扣除我两个月的工资？合理吗？

　　不适应用人单位的工作要求与劳动条件可以解除劳动合同关系；但不能侵犯劳动者的依法获得劳动报酬权。
　　社会保险方面公司有责任为人交纳劳动关系存续期间的社会保险，但往上推只能支持两年，超过两年部分主张受限，因为劳动监察条例受理期限是两年，过两年部分主张没有法理支持了。

既然已经答应要去，现在返回，要看你不去的理由，够不够充分。
也要看你反悔时离出差日多远，公司又没有应对的时间，以及因为你突然改变主意，给公司带来的影响。

扣工资算是处分吧，辞退就要看上面两样条件了。具体问题要具体分析。
如果是因不可抗力的因素，导致你不能去，都没有理由扣工资，更不用说辞退了。

你可以申请劳动仲裁，这种情况你一定会赢的，申请劳动仲裁的情况如下：
（一）因确认劳动关系发生的争议；­
　　（二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议；­
　　（三）因除名、辞退和辞职、离职发生的争议；­
　　（四）因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议；­
　　（五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议；­
　　（六）法律、法规规定的其他劳动争议。­

不合理，如果他强势这样，建议你找律师