您好，您说的E盘估计使用约200多GB，全部选中根目录所有文件不到100GB，这个差异主要是根目录中存在隐藏的文件或文件夹，通常这些文件是程序的缓存文件。可以将这些文件全部显示出来以区分是否可删除，通常情况下是可删除的。
显示全部文件的方法：如WIN7系统，1、打开我的电脑即资源管理器界面点菜单栏下的组织--》文件夹和搜索选项，打开文件夹选项。2、在文件夹选项窗口中切换到查看选项卡，在高级设置里面找到“隐藏受保护的操作系统文件（推荐）”取消此项前面的勾。并选中“显示隐藏的文件、文件夹和驱动器”。点确定按钮使修改生效。3、重复第1和第2步骤，看状态是否是修改后的状态，排队系统中毒影响此步骤被病毒修改回去。4
再次查询系统中所有的文件都会显示出来。此时如全部选中E盘文件容量是吻合的。希望能帮到你，祝好运！
查看下隐藏文件
可以考虑一下把那个盘格式化一下
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