一、复制起始位点不同：
1、原核生物有9-mer和13-mer的重复序列构成的复制起始位点。
2、真核生物为线性DNA，具有多个复制起始位点，形成多个复制叉，DNA聚合酶的移动速度较原核生物慢。
二、DNA复制时期不同：
1、真核生物DNA复制只发生在细胞周期的S期，一次复制开始后在完成前不再进行复制。
2、原核生物多重复制同时进行。
三、相互作用不同：
1、真核生物DNA聚合酶δ的高前进能力来自于RF-C蛋白与PCNA蛋白的互相作用。
2、原核生物DNA聚合酶III的前进能力来自与γ复合体（夹钳装载机）与β亚基二聚体（β夹钳）的相互作用。
参考资料来源：百度百科-DNA合成
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