A、氨基酸脱水缩合产生水,水中的氢只来自氨基酸的氨基和羧基,A错误; B、蛋白质中的氮元素主要存在于肽键中,B错误; C、蛋白质变性只是空间结构发生改变,肽键并没有变化,双缩脲试剂与肽键结合产生紫色反应,C正确; D、蛋白质的合成场所为核糖体,D错误. 故选:C.