之前做的3‘RACE,不知道怎么确定polyA的位置,查文献看见,polyA的上游有AAUAAA序列,这个是什么意思?

我应该如何在测序结果中查找?是查找AATAAA?还是需要反向互补,查找TTTATT?这个我知道的,但是文献中说到PolyA上游肯定有AAUAAA,我想知道如何查找
2026年09月27日 07:35
有2个网友回答
网友(1):

做3' RACE如果成功的话,序列里是会有polyA的。
如果测序是正向的话,序列测通之后,序列里会含有polyA,很明显用肉眼就能找到。
如果测序是反向的话,序列测通之后,序列里会含有polyT,也很明显,只要把这个序列互不反转,就是含有polyA了。

网友(2):

AAUAAA好像是生成polyA的那个酶的识别位点吧 没记错的话