农村房屋离婚时有协议的，可以按照协议进行分割处理；没有协议的，发生纠纷时，应根据平等协商原则，对农村房屋进行合理划分；协商不成的，可以向法院起诉，一般法院根据对财产的贡献大小等情况合理确定双方的份额。
【法律依据】
根据2021年1月1日起生效施行的《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
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