热岛效应使得城市里的废气不能扩散，只能集中在城市里。造成城市空气的污染得不到缓解，使得城市空气质量更差。在“热岛效应”的影响下，城市上空的云、雾会增加，使有害气体、烟尘在市区上空累积，形成严重的大气污染。
