不可以。劳动者上班了但是没打卡，公司要扣劳动者的工资是不合理的，用人单位可以根据考勤制度和绩效考核制度扣取部分绩效工资。劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。
