会的,一般都是在硬盘分区的时候4K对齐,也有一些硬盘厂商提供系统下4K对齐的软件,请看教程http://jingyan.baidu.com/article/76a7e409bc083cfc3b6e15a7.html
用分区助手,可以不用重新分区对齐