A、东北虎和华南虎不是两个物种，不存在生殖隔离，A错误；B、东北虎与华南虎由于地理障碍不能进行基因交流，是地理隔离导致华南虎和东北虎属于两个亚种，B正确；C、由A分析可知，C错误；D、由B向分析可知，D错误．故选：B．
