喜克索人所崇奉的主神是埃及风暴与沙漠之神塞特(Seth),他们把塞特与一个亚洲的风暴之神视为一体。他们自阿瓦利斯发号施令,统治著下埃及与上埃及的大部地区,其政令所及,可达赫尔莫波利斯(Hermopolis)。他们通过诸埃及封臣,延伸统治势力南达库塞(Cusae),一度甚至超出该地范围之外。後来底比斯人在塞格嫩拉(Seqenenre)及卡莫斯(Kamose)的领导下发动叛乱,当时喜克索法老阿波皮一世(Apopi I)曾试图与库施(Cush)统治者结盟,但未实现。库施统治者曾在埃及第十三王朝末期(1650?BC)入侵埃及治下的努比亚(Nubia)。
底比斯人的叛乱在卡莫斯领导下向北推进,前1521年左右,卡莫斯的继承人雅赫摩斯(Ahmose)率叛军攻陷阿瓦利斯,结束了喜克索人对埃及108年的统治,开始建立埃及第十八王朝。尽管自哈特谢普苏特(Hatshepsut)在位之时起,埃及人曾对喜克索人有所诋毁,喜克索人却曾以法老之位统治埃及,而在杜林纸莎草纸中所示埃及列王名单上同属合法君主。喜克索人最低限度已在表面上埃及化了,而且他们统治埃及期间,对於政治范畴之外的埃及文化,未曾进行过干涉。