是的，农村合作医疗只有住院才给报销，不光药费，在住院期间的所有费用，扣除起伏线及各种自费项目后，按一定的比例报销。农村合作医疗各省有不同的规定，有的地方是可以报销部门门诊费用的，有的地方不可以。
只有住院才给予报销，有些慢性病门诊也可以报。而且有些药费也不能报销。每个地方的规定不同，最好去当地农医局咨询下。
门诊按照门诊的规定可以按照比例报销，住院的话有些药品不能报销
