新买的Nikon D90拍夜景很脏.

这不是相机本身的问题，而是摄影环境与相对的技法不匹配。
夜景的风景照有几个要点：
1、不能使用闪光灯：对于空气质量差的地方（尤其是城市），空气中悬浮颗粒物多，使用闪光栋会使这些悬浮颗粒物反射闪光灯光。而且使用闪光灯会影响场景的色调。
2、感光度（ISO）要尽量低。在夜景风光题材，如果想以高ISO提高快门速度，高ISO就会使得画面不干净，有噪点。
3、光圈要收小。如果夜景场景中有较为明显的点光，收小光圈可以制造出星芒效果。一般套头，收到F8或更小为宜。
4、达到以上这些要求，快门就会放慢，手持拍摄是不切实际的，此时要很好地固定机身，要把机身放在稳固平台上，又或者准备三角架。
5、题外话，要尽量减少机身在开始拍摄时的震动，应该设置为自拍模式（按了快门后倒计时的那个），又或者装备快门线或红外遥控器。中、高端机型具有反光板预升功能的也应该使用之（避免反光板提升时带来震动）。

你有没有开闪光灯？如果是开了闪光灯的话，那是因为空气中的灰尘反光造成的，
晚上要拍片的话，最好是上架子拍，小光圈、慢快门，一般这样拍出来的就不会有你讲的这种情况了。记得，夜景除了拍近处人像外，千万不要开闪光灯。
我又看了下你发的照片，发现你这个更大的一个问题是没有对上焦，你的镜头前是不是加了个UV镜之类的？可能是UV镜太脏了造成的这种情况。

你肯定用的是自动模式
ISO自动调节了 出现的噪点。
你可是使用三脚架，固定ISO比如200 或者400 会解决你的问题的。

朋友，从你图片看出只拍摄霓红灯的房屋框架，房屋的细节没有了，这是不合格的夜景拍摄。
有可能是ISO值太高，另外如楼上各位朋友说的开了闪光灯。
建议上三脚架，低ISO值，以亮部测光读数再加两级。后期曲线调整压暗亮部就可以了。

拍摄的时候没有用三脚架吧？另外对焦也有问题，完全是模糊的

夜景嘛，光比白天少，所以快门就慢。
必须用三脚架。
如果你拍的是晚上的夜市等在强烈灯光下的夜景，可以把iso调到400或者800，再高了高质就难以接受了。然后用你镜头的最大光圈，比如说f3.5或者f2.8。这样快门速度也能比较快，手持也能不糊。