①水是由水分子构成的. ②二氧化碳是由二氧化碳分子构成的. ③氧气属于气态非金属单质,是由氧分子构成的. ④水银是金属汞的俗称,是由汞原子直接构成的. ⑤氦气属于稀有气体单质,是由氦原子直接构成的. ⑥氯化钠是由钠离子和氯离子构成的. 故答案为:①②③;④⑤;⑥.