A、酶是一类有机催化剂，催化剂的特点是反应前后化学性质不会发生变化，所以酶催化底物时，不会转变成另外一种物质，A错误；
B、酶是大分子物质，不可能来自食物，只能在细胞内合成，B错误；
C、蛋白质能够与双缩脲试剂发生反应，但蛋白质不一定就是酶，比如胰岛素不是酶而是激素，C错误；
D、酶的化学本质绝大多数是蛋白质，合成蛋白质的场所是核糖体，但是少数的酶是RNA，所以只能说核糖体是合成酶的主要场所，D正确．
故选：D．
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