领导职数为局长 1 名，副局长 4 名，调研员 2 名。局机关现内设 5 个行政科室，即办公室、政策法规科、规划管理科、监督管理科和生态保护科；直属事业单位 10 个，即市环境信息服务中心、市环境监察支队、市环境监测站、市环境科学研究所、市梅湖水质净化中心、市固体废物管理站、市环境技术中心、陈江片办事处、水口片办事处和横沥处办事处，均为正科级建制。
