DNA带负电，电泳向正极移动，由于不同DNA片段的大小不同，所以电泳时移动速度不同。因此可以分离。
不同的蛋白质在不同的缓冲液中所带电荷一般不同，分子质量也一般是不同的，因此利用以上两方面的差别，电泳时不同蛋白质移动方向，移动速度不同，可以彼此分开。
DNA可以用琼脂糖凝胶电泳进行分离，分离开后使用胶回收试剂盒进行DNA片段的回收。蛋白质同理，只是使用的凝胶是聚丙烯酰胺凝胶，还要注意还原电泳和非还原电泳。具体步骤上网找吧
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