A、岩石圈是指地壳和上地幔顶部，所以地壳应该是岩石圈的一部分，故不符合题意；B、岩石圈是由地壳和软流层以上的地幔部分（也就是上地幔顶部）组成的，故正确；C、生物圈存在于大气圈的底部、岩石圈的上部和水圈的全部，因此生物圈与岩石圈的上部重合，故不符合题意；D、软流层以上的地幔部分和地壳构成岩石圈，因此岩石圈的下部是软流层，故不符合题意．故选：B
