主要用细菌和真菌。细菌: 假单胞菌属、芽饱杆菌属、节细菌属、棒状杆菌属、黄杆菌属、黄单胞杆菌属、固瘤细菌属、硫杆菌属等。真菌有:曲霉属、青霉属、木霉属、酵母菌等。藻类对有机磷也有降解作用,如小球绿藻属降解甲拌磷、对硫磷等。降解主要存在两种方式:一种是微生物本身含有可降解磷的酶系基因。 另一种是微生物本身并无可降解该磷的酶系,当磷进入环境后,由于微生物生存的需要,微生物在适应环境的过程中基因发生重组或突变,产生新的降解酶系。