∵抛物线顶点在原点,焦点在y轴上,点P(m,-3)在抛物线上,∴抛物线的开口向上,可设抛物线的方程为x2=-2py(p>0),∵点P(m,-3)到焦点距离为5,∴根据抛物线的定义,得P到准线y= p 2 的距离等于5,可得 p 2 +3=5,解得p=4,所以抛物线方程为x2=-8y.故选:B.