农业银行卡余额不足，如果没有进行交易，是不会扣钱的，如果进行交易，支付金额大于卡里余额，是会提示支付失败，重新支付。农行卡余额不足100元的农行每月要扣6元。农行卡收费情况：1、月均余额低于300元，会收每季度6元的小额账户管理费。2、农行卡每年要收取10元的年费。
