在自然选择的作用下,种群的基因频率会发生变化,只不过这一过程需要一定时间。基因突变具有不定向性,对于同一性状,它可能产生多种相对性状,这个是作用于个体的,也可以理解为,发生基因突变是个体层次上的,但是环境不变或者环境变化的时候,必然会出现有的基因适合当前环境,而有的突变基因是不适合,不适合即被环境淘汰,经过一段时间的演变,最终在种群中呈现的结果就是一部分突变基因越来越多,而其他的基因类型相对减少。种群的基因频率自然发生了变化。