色氨酸是人体必需氨基酸，也是唯一含有吲哚结构的氨基酸，由膳食蛋白质提供。尽管摄入的大部分蛋白质在小肠中被消化和吸收，根据摄入量高低会有大量蛋白质和氨基酸（6-18g /天）到达结肠部，并由一系列共生菌群降解。随着蛋白质摄入增加、结肠碳水化合物耗尽、结肠pH增加以及结肠排空时间延长，菌群蛋白质分解代谢将会增加。结肠近端到远端发生的碳水化合物底物逐渐消耗会诱导菌群分解代谢从糖分解转变为蛋白水解发酵。已有报道表明特异依赖蛋白水解酶细菌的生长潜力低于非特异细菌和依赖糖代谢/脂肪代谢酶细菌，这说明当快速生长生态压力降低时，依赖蛋白水解酶细菌会快速生成。
醋酸杆菌与动物肝脏细胞的结构与代谢是
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