同科学院以新机制和新模式进行运行和管理，在学院的办学过程中，学习借鉴德国科技大学的培养模式，坚持以培养技术应用型本科层次人才为根本任务，坚持以技术应用能力培养为主线，坚持走产学结合、校企合作的办学之路。以市场为导向，学院的学科结构规划以工为主，兼设文、经、管、医、艺术等专业门类，以满足上海及长三角等地区的经济与社会发展对高层次技术应用型人才的需求，并逐步形成同科学院自身鲜明的办学特色。
同科学院以科学发展观统领其建设与发展，树立现代教育思想与办学理念，面向市场，依托母体，独立办学，错位发展，注重特色，讲究质量。创新教育理念，创造培养模式，创建实践环节，实施知识、能力、人格三位一体的综合素质教育，努力培养应用性、技术型、个性化人才，适应生产、建设、管理、经营、服务等一线的需求。
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