香蕉穿孔线虫对香蕉和胡椒的为害是毁灭性的。在其分布地区，香蕉产量的损失主要是由其为害引起的，一般能造成香蕉减产40%～80%。1969年苏里南的香蕉由于该线虫的为害减产50%以上。在印度尼西亚的邦加岛，该线虫为害胡椒，造成90%的胡椒树死亡，20年内毁掉2200万株胡椒树。香蕉穿孔线虫还可严重为害大豆、小豆蔻、生姜、玉米、高粱、甘蔗、茄子、番茄、马铃薯、咖啡和一些观赏植物。
