A、5s内是指5的时间，在4s末到5s末是指1s的时间，故A错误；B、第4s末和第5s初在时间轴上对应同一个点，指的是同一个时刻，故B正确；C、路程是标量，大小等于运动轨迹的长度．位移是矢量，大小等于初末位置间的距离，与运动路线无关，故CD错误．故选：B
